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混合模式色譜柱可被認為是疏水性的離子交換劑——相對于親水性更強的用于傳統的IEC（離子交換色譜）色譜柱。常用的混合鍵合相有三種模式：反相/陰離子交換、反相/陽離子交換、反相/兩性物質。結果是這類色譜柱同時表現出RPC（反相色譜）和IEC的行為。使用混合模式的起因是，與RPC或IEC柱相比，他們具有*的選擇性。
混合鍵合相的優勢有：
1 | 高選擇性，可提供與反相及離子交換不同的選擇性； |
2 | 流動相無需使用離子對試劑即可分離強極性物質； |
3 | 可以同時分析分離不同類型的化合物（帶正電、負電和中性物質）； |
4 | 可直接進行質譜分析。 |
混合模式分離的保留行為能通過改變B%、pH、緩沖鹽或鹽的濃度控制。
月旭現有的混合模式色譜柱有：
Ultimate® NH2/CN鍵合相，新柱的保存溶劑是正己烷-異丙醇。當作為反相模式使用時：做樣流動相中含有甲醇、乙腈、水等極性溶劑，活化方式如下：
當作為正相模式使用時：做樣流動相中含有正己烷、異丙醇等弱極性溶劑，活化方式如下：
日常維護和保存（建議反沖）：
當色譜柱使用一段時間后，出現壓力升高、峰形異常、柱效降低、分離度下降等異常情形時，先用過渡流動相沖洗掉色譜柱中的緩沖鹽，再按照如下方式沖洗（建議反沖）：
Ultimate® C18/SCX、Ultimate® SCX/C18鍵合相，新柱的保存溶劑是甲醇/水。活化方式如下：
日常維護和保存（建議反沖）：
當色譜柱出現柱壓升高、峰形異常、柱效降低、分離度下降等異常后，先使用過渡流動相沖洗掉色譜柱中的緩沖鹽，再按照如下方式沖洗，其中，如果流動相中使用了離子對試劑，需先用50%甲醇沖洗后，再按照下表沖洗（建議反沖）：
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